全般的にケニアは乾燥した国です。国土の75%以上は乾燥、または半乾燥地域に分類され、農業に適した地域は約20%に過ぎません。内陸部の降雨と気温は高度の変化と密接に関連し、各地の地形によって変化します。

気候はおおまかに言うと、沿岸部は温暖で湿潤、中央部のハイランド地区は冷涼で湿潤、北部および東部は高温で乾燥しています。国内のほとんどの地域で降雨は非常に季節周期的ですが、そのパターン、時季、および程度は場所ごと、また年ごとに大きく異なります。

インド洋に面し、比較的に湿潤な沿岸部は年間1,000ミリ以上の降雨があります。南東からのモンスーンがあるため、降雨のほとんどは4～7月に集中します。これ以外に降雨量の多い地域としては、ビクトリア湖の堆積盆地およびその周囲の斜面と台地で、主に大西洋およびコンゴ盆地から発生する湿った西風によるものです。湖岸部を除いて、降雨は確実に3～11月にあります。

この地域に隣接した高原は湖の影響が少なく、主として3～5月と7～9月に降雨があります。中央のハイランド地区の多くも雨季が2つに別れ、3～5月と10～12月に降雨があります。

これ以外の約70%の地域は、「乾燥低地」帯（NRI 1996）に分類され、年間の平均降雨量が500ミリ未満で、年ごとに大きく異なります。

ほとんどの地域の降雨のピークは11月と4月です。この地域の約30%は、半砂漠に分類され年間の平均降雨量が300ミリ未満で水分蒸発が3,000ミリを上回ることも珍しくありません。

沿岸部およびビクトリア湖地域を除き、降雨量には標高が大きく関係します。通常、ケニア中央部のハイランド地区の標高の高い地域（海抜1,500メートル以上）は、実質的に降雨量がかなり多く、マウエスカープメントの一部では年間降雨量が2,000ミリに達することもあります。

ただし、地形による作用を大きく受け、ケニア山の東側およびアバーディア山脈では風下側の降雨量が非常に少なくなるという影響があります。このため、高度１,800メートルを超える地域でも比較的乾燥しています。乾燥低地では、独立峰の頂上によって雲と霧が引き寄せられることが一因となり、その周囲の平野の植生の多様化をもたらしています。

気温の差は高度差によるものです。高度3,000メートルでは一般的に霜が発生し、2,400メートル以上の地域でもときどき発生します。また、標高5,200メートルのケニア山の頂上は万年雪と氷に覆われています。最も気温の高い地域は乾燥した北東部、トゥルカナ湖の西部で、平均最高気温は34℃を超えています。